The role of trans-translation in cellular differentiation and resistance to produced antibiotics in Streptomycetes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/05/0106
Alternative language
Project name in Czech
Význam trans-translace v buněčné diferenciaci a rezistenci k produkovaným antibiotikům u streptomycet
Annotation in Czech
Transfer messenger RNA (tmRNA, SsrA, 10aS RNA) obsahuje aktivity tRNA i mRNA, které se uplatňují v unikátní kontrole kvality proteosyntézy (trans translace. Kmeny s inaktivovaným genem ssrA budou použity k vysvětlení, zda tmRNA ovlivňuje rychlost růstu,buněčnou diferenciaci, odpověď na stres nebo rezistenci k produkovaným antibiotikům u streptomycet. Disrupce ssrA genu bude provedena náhradou genové sekvence omega kazetou obsahující marker pro antibiotickou resistenci nebo jednostupňovou inaktivací pomocí PCR produktu umožňující rychlý vznik nepolární delece. K důkazu, že pozorované změny fenotypu u deltassrA kmenů jsou způsobeny inaktivací tmRNA bude použita komplementace pomocí multikopiového plasmidu nesoucího ssrA gen pod vlastním promotorem. Proteomické experimenty budou použity k identifikaci změn v expresi proteinů u deltassrA kmene a rodičovského kmene kultivovaného za stresových podmínek. Proteiny budou radioaktivně označeny 35S methioninem a po 2D elektroforetické separaci a
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Microorganisms contain a ribonucleoprotein complexes that permit particular transfer informations from DNA to RNA and proteins. One of the important control mechanisms involves tmRNA. The aim of the project was to clarify the structure of ssrA genes of s
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
1,759 thou. CZK
Public financial support
1,759 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK