Tetraplexes in the human genome
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/07/0057
Alternative language
Project name in Czech
Tetraplexy v lidském genomu
Annotation in Czech
Tetraplex je biologicky aktivní alternativou Watsonova-Crickova duplexu DNA. Nejvíce je jeho výskyt prostudován v telomerách, kde se uplatňuje zatím neznámým mechanismem v procesu stárnutí a rakovinného bujení. U řady genů bylo ukázáno, že tvorba tetraplexu v oblasti jejich promotoru rozhoduje o jejich expresi či umlčení. Sekvenační studie ukázaly, že v lidském genomu existují tisíce míst s primární strukturou DNA vhodnou pro vznik tetraplexu. Pomocí bioinformatických metod budeme tato místa hledat v oblastech významných z hlediska jejich biologické funkce či patologie. Pomocí CD a UV absorpční spektroskopie, gelové elektroforézy, PCR, nukleázových a chemických prób a počítačového modelování zjistíme, zda vybrané úseky DNA tetraplexy skutečně tvoří, jaké je jejich uspořádání, stabilita, termodynamické parametry a jaké jsou možnosti ovlivnění jejich tvorby ve vztahu k jejich funkci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
2,783 thou. CZK
Public financial support
2,783 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK