DNA quadruplexes in the human genome associated with diseases and aging
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P205-12-0466
Alternative language
Project name in Czech
Kvadruplexy DNA v lidském genomu související s nemocemi a stárnutím
Annotation in Czech
V lidském genomu existuje množství úseků, které jsou náchylné tvořit kvadruplexová uspořádání DNA. Vyskytují se frekventně v promotorových oblastech genů a často rozhodují o jejich expresi. V projektu se zaměříme na kvadruplexy tvořené telomerní DNA a DNA vybraných onkogenů. Tyto kvadruplexy ovlivňují stárnutí a rakovinu a jsou tedy terčem pro vývoj antirakovinných agens. Dalším aktuálním problémem je přeměna diferencovaných tělových buněk v pluripotentní buňky kmenové. Hlavním pluripotentním regulátorem je gen oct4, pro jehož funkci je důležitý úsek v promotorové oblasti se sekvencí schopnou tvořit kvadruplex. Zaměříme se na zjištění, za jakých okolností se kvadruplexy tvoří, jaké mutace a další faktory jejich tvorbu ruší nebo potencují. Vyhodnotíme závislost tvorby a vlastností kvadruplexů na změnách v primární struktuře DNA u zdravých a nemocných jedinců. Využijeme našich zkušeností s predikcí tvorby kvadruplexu a jejich experimentální detekcí a charakterizací. Získané poznatky budou základem pro perspektivní využití při cílené léčbě rakovinných a jiných onemocnění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The objectives have been achieved. The original findings regarding the DNA quadruplex structures were obtained. The results were published in 14 journal articles and at 14 conferences. The results can contribute to the development of new drugs and therapies. The outcomes are competitive at the international level. The funds were used effectively.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
5,753 thou. CZK
Public financial support
5,753 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK