Tetraplexes of DNA and Their Occurrence in the Human Genome
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Tetraplexy DNA a jejich výskyt v lidském genomu
Annotation in Czech
Tetraplex je biologicky aktivní alternativou dvojité šroubovice DNA. Dosavadní studie malé části lidského genomu naznačují, že v něm existují tisíce oblastí náchylných ke tvorbě tetraplexů. V tomto projektu navrhujeme prozkoumat vybrané soubory fragmentůDNA tak, abychom na základě jejich chování mohli formulovat pravidla pro predikci, které nukleotidové posloupnosti a za jakých podmínek budou tvořit monomolekulární a bimolekulární tetraplexy. Tato pravidla odstraní existující rozpory v literatuře a umožní lépe pochopit zákonitosti tvorby tetraplexů. Těchto pravidel využijeme k nalezení míst v lidském genomu náchylných ke tvorbě tetraplexu. Z nich některé podrobíme experimentálním testům, abychom zjistili, jak pravidla pro predikci tetraplexů vytvořenáv tomto projektu fungují.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We formulated rules controlling folding of four G3 blocks into different tetraplex types depending on base sequence of loops. We detected and characterized a number of tetraplexes in human genome fragments and in other important sequential motifs of DNA.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-IA-U/03:3
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
5,078 thou. CZK
Public financial support
2,524 thou. CZK
Other public sources
2,554 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK