Characterization of a novel protein complex involved in RNA processing and editing in the mitochondrion of Trypanosoma brucei
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204-09-1667
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace nového proteinového komplexu účastnícího se editování a úprav RNA v mitochondrii Trypanosoma brucei
Annotation in Czech
Editování RNA u bičíkovce Trypanosoma brucei je proces nezbytný pro zrání mitochondriálních (mt) mRNA. Jeho klíčovou součástí je proteinový komplex označovaný jako 20S editosom a molekuly guide (g) RNA. RNA-vážící protein TbRGG1 se tohoto procesu rovněžzúčastní a jeho afinitní purifikace nám umožnila objev nového makromolekulárního komplexu. Jelikož mají některé součásti tohoto komplexu motivy svědčící pro jejich funkci v metabolismu RNA, označujeme jej dočasně jako ?mitochondriální RNA-vážící komplex1?. Předběžné výsledky s RNA interferencí proti třem jeho podjednotkám naznačují, že se jedná o sadu subkomplexů s různými funkcemi při úpravě mt RNA, včetně přepisu a úprav gRNA. Účast v tomto velmi málo známém procesu navíc naznačují výsledky získané protilátkou proti podjednotce komplexu, které jej lokalizují do definované oblasti v těsné blízkosti mt DNA. Cílem této žádosti je přesný popis složení tohoto komplexu a poznání funkcí proteinů, které ho vytváří. Zaměříme se zejména na funkce souvisejícís přepisem gRNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Realization of grant produced unique outcome, 23 publications in scientific journals with IF (total IF of journals is 116.7). This project led to the identification and subsequent characterization of a novel RNA-editing protein complex MRP1 that is now being intensely studied by several laboratories and is considered as one of the potentially promising drug targets for human pathogen T. brucei.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
4,702 thou. CZK
Public financial support
4,702 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK