The influence of allopolyploidy on the evolution and expression of rDNA loci in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-16826S
Alternative language
Project name in Czech
Vliv alopolyploidie na evoluci a expresi lokusů rDNA u rostlin
Annotation in Czech
Polyploidie (multiplikace chromosomových sad) je dlouhodobě v popředí zájmu evolučních biologů, ekologů a šlechtitelů. U vyšších rostlin polyploidie významně ovlivňuje druhovou rozmanitost a sehrává zásadní roli při vzniku mezidruhových bariér a v invasivních procesech. Geny pro ribosomální RNA (rDNA), které jsou nezbytnou součástí každé buňky, hrají důležitou úlohu v proteosyntéze, metabolismu a stabilizaci genomu. Přes relativní neměnnost primární nukleotidové sekvence rDNA vykazuje překvapivě variabilitu v organizaci, pozici na chromosomech a počtu kopií. Navrhovaný projekt si klade ta cíl studovat důsledky alopolyploidie (procesu, kdy polyplodii předchází mezidruhová hybridizace) na strukturu a expresi rDNA u rostlin. Kombinací genomických a cytogenetických přístupy budeme detailně mapovat rDNA lokusy v oblasti chromosomálních zlomů. Předmětem studia budou jak přirozené druhy (včetně invasivních) tak i syntetické alopolyploidní linie. V širší evoluční studii budou pak zkoumány vztahy mezi multiplicitou rDNA, velikostí genomu, intragenomovou homogenitou a velkostí genomu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
11,723 thou. CZK
Public financial support
11,541 thou. CZK
Other public sources
182 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK