Exploring eukaryotic genome evolution: lessons from non-model Euglenozoa
Project goals
Understanding evolution of fundamental cellular structures and processes is only possible, when the analyses cover eukaryotic diversity outside popular model organisms. Euglenozoa, incorporating diplonemids, kinetoplastids and euglenids, belong to the most divergent branches on the eukaryotic tree of life. Ecological success of diplonemids, the most diverse group of marine eukaryotes, and kinetoplastid parasites with a wide host range and an impressive parasitic molecular toolkit, is undeniable. Genome changes underlying lifestyle switches in kinetoplastids are relatively well-studied only in human pathogens, while genomic basis of ecological success of diplonemids remains enigmatic. Lifestyle switches are accompanied not only by changes in gene repertoire and expression, but also in gene structure. In contrast to nearly intronless kinetoplastid genomes, diplonemids and euglenids are rich in cis-spliced introns, including those with atypical borders. We are aiming at investigating genome evolution in Euglenozoa, with potential implications for eukaryotic evolution in general.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-07695S
Alternative language
Project name in Czech
Zkoumání evoluce genomu u eukaryot: poučení z nemodelových euglenozoí
Annotation in Czech
Pochopení evoluce klíčových buněčných struktur a procesů vyžaduje jejich studium nejen u vybraných modelových organismů, ale i u představitelů pokrývajících eukaryotickou rozmanitost. Euglenozoa, zahrnující diplonemy, kinetoplastidy a eugleny, patří mezi nejodvozenější skupiny eukaryotického stromu. Je mimo veškerou pochybnost, že diplonemy, představující nejrozmanitější mořské eukaryoty, a kinetoplastidi, kteří se vyznačující širokým spektrem parazitických adaptací, patří mezi evolučně mimořádně úspěšné prvoky. Zatímco genomické změny umožňující parazitismus jsou intenzivně studované u kinetoplastid parazitujících u člověka, nevíme prakticky nic o diplonemech, což jsou jejich ekologicky úspěšní příbuzní. Změny životní strategie se projevují nejen proměnami genových sad a jejich exprese, ale i ve struktuře genomů. Zatímco genomy kinetoplastid postrádají introny, genomy diplonem a euglen jsou zaplněné cis-introny, které mají navíc často netypické vlastnosti. Naším cílem je studovat evoluci genomů u euglenozoí s cílem určit trendy a mechanismy obecně platné pro všechna eukaryota.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
6,441 thou. CZK
Public financial support
6,329 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
6 441 CZK thou.
Public support
6 329 CZK thou.
98%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Solution period
01. 03. 2023 - 31. 12. 2025