Time-resolved vibrational spectroscopy of proteins assisted by genetically encoded non-canonical amino acids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-11819S
Alternative language
Project name in Czech
Časově rozlišená vibrační spektroskopie proteinů za užití geneticky kódovaných nekanonických aminokyselin
Annotation in Czech
Časově rozlišená Ramanova a infračervená spektroskopie může poskytnout kinetické a strukturní informace až v řádech femtosekund. Nicméně, existují dvě vlastnosti, které brání širší aplikaci tranzientní vibrace v biofyzice proteinů. První je dána překrývajícími se pásmy obvykle bránící selektivnímu zkoumání přírodních proteinových vazeb a druhou je použití UV/viditelných laserových impulzů k excitaci chromoforu a zahájení reakce, což zásadně omezuje počet cílových systémů. Navrhujeme proto univerzální strategii pro zahájení a sledování nerovnovážné proteinové strukturní dynamiky založené na geneticky kódovaných nekanonických aminokyselinách (ncAA). Nové ncAA nesoucí frekvenčně rozlišené značky, které signalizují místní změny vodíkových vazeb a elektrických polí, a nové fotoreaktivní ncAA, které vyvolávají změny ve skladování proteinů a afinitě vázání světlem budou inkorporovány do produkovaných proteniů. Vyvinuté metody pomohou odhalit cesty šíření signálů v transkripčním faktoru EL222 a interakční mechanismy mezi interleukinem-24 a jeho receptory.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10609 - Biochemical research methods
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 27, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
8,160 thou. CZK
Public financial support
8,160 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK