Construction of Silene latifolia BAC library and its application
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Konstrukce BAC knihovny Silene latifolia a její využití
Annotation in Czech
Předkládaný projekt je zaměřen na konstrukci a následné využití BAC (bacterial artificial chromosome) knihovny knotovky bile (Silene latifolia, syn. Melandrium album). Bude to první BAC knihovna dvoudomé rostliny i dvouděložného druhu s velkým genomem. S. latifoliaje populárním modelem ke studiu determinace pohlaví a evoluce pohlavních chromozomů. BAC knihovny v současnosti představují jedinečný nástroj strukturní, funkční a evoluční genomiky. Při konstrukci knihovny budou využity nejmodernější molekulárně-biologické postupy včetně použití robotů, s cílem vytvořit reprezentativní BAC knihovnu s velkými inzerty. Knihovna bude analyzována především z hlediska délky inzertů a budou selektovány BAC klony vhodné pro fluorescenční in situ hybridizaci(FISH).Cílem FISH experimentů bude lokalizace známých genů a obecně studium chromozomální distribuce genů u S. latifolia. Při studiu distribuce genů budou také aplikovány BAC klony z Arabidopsis thaliana vyznačující se vysokou hustotou genu. Dále bude
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Silene latifolia is the most popular plant model to study sex determination and sex chromosomes structure and evolution. BAC libraries represent the powerful tools used in modern genomics allowing mapping of complex genomes. We have constructed and chara
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
3,774 thou. CZK
Public financial support
2,389 thou. CZK
Other public sources
1,385 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK