Detection of DNA polymorphism of candidate genes for performance in pigs
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Detekce polymorfismu DNA a kandidátních genů pro užitkovost prasat
Annotation in Czech
Předmětem projektu je detekce polymorfismu na úrovni DNA a určení alelických variant vybraných kandidátních genů u prasete. Výběr konkrétních kandidátních genů ovlivňujících masnou užitkovost a reprodukční vlastnosti bude proveden na základě aktuálního stavu mapování genomu prasete, a to z chromozomových oblastí, ve kterých byla prokázána existence QTL. Specifické úseky genů budou izolovány pomocí metody polymerázové řetězové reakce na základě primerů navržených podle EMBL databáze u prasete nebo podlehomologií s úseky lidské nebo myší DNA. V těchto fragmentech bude vyhledáván polymorfismus pomocí molekulárně genetických metod PCR-RFLP, DGGE, TTGE aj., z nichž některé budou na pracovišti nově zavedeny. Nalezený polymorfismus bude testován na populacícprasat chovů v ČR a hlavně na zvířatech třech referenčních rodin prasat připravených Universitou v Hohenheimu. Výsledky budou využitelné pro následné mapování genů a QTL, výpočtu genových efektů a přispějí k celkovému poznání genomu prasete. To by mohlo
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Řešením grantu vzniklo 5 publikací (4 vyšly, 1 přijata). Ve 4 případech se jedná o Anim. Genet., prestižní časopis v daném oboru. Práce řešitele významně obohatila navazující grant a přispěla k prohloubení znalostí o genomu prasete. Doporučujeme hodnotit
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
680 thou. CZK
Public financial support
557 thou. CZK
Other public sources
330 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK