Detection and characterization of single nucleotide polymorphisms of candidate genes for fertility and meat performance in pig
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Main participants
Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Detekce a charakterizace jednonukleotidových polymorfizmů kandidátních genů pro plodnost a masnou užitkovost u prasete
Annotation in Czech
Cílem projektu je detekce jednonukleotidových polymorfismů (SNPs) DNA a určení alelických variant u vybraných kandidátních genů prasete. Volba konkrétních kandidátních genů ovlivňující masnou užitkovost a reprodukční vlastnosti bude vycházet z aktuálníchpoznatků mapování genomu prasete a bude zaměřena na chromozomové oblasti, ve kterých byla prokázána existence QTL (především chromozomy X a 4), ale i jiné dle potřeby (receptorové geny). Specifické úseky genů budou amplifikovány pomocí metodypolymerázovéřetězové reakce (PCR) s použitím primerů navržených podle databází sekvencí (EMBL) u prasete nebo na základě podobnosti s úseky lidské nebo myší homologní DNA. V těchto úsecích bude vyhledáván polymorfismus pomocí molekulárně genetickýchmetod PCR-RFLP, SSCP a sekvenování, z nichž některé budou na pracovišti nově zavedeny. Nalezený polymorfismus bude testován na populacích prasat chovů v ČR a na zvířatech třech referenčních rodin prasat připravených Universitou v Hohenheimu. Získané
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The aims of the presented project were a detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of DNA and a determination of allelic variant of selected candidate genes in pig. Apolipoprotein A2 (APOA2), myogenic factor 6 (herculin, MYF6), adiponectin (ADP
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GP-U/06:6
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
944 thou. CZK
Public financial support
590 thou. CZK
Other public sources
354 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK