Interactions of organometallic antitumor compounds with nucleic acids and proteins: study of sequence and substrate selectivity
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Zdravotně sociální fakulta<br>Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P208-12-0622
Alternative language
Project name in Czech
Interakce organokovových protinádorových komplexů s nukleovými kyselinami a proteiny: studium sekvenční a substrátové selektivity
Annotation in Czech
V současnosti existuje silná poptávka po protinádorových léčivech, které by byly více účinné a méně toxické než cisplatina. Mechanismus účinku cisplatiny a příbuzných léčiv spočívá především v jejich vazbě na DNA. Ta vede ke změně struktury DNA a změně jejích interakcí s proteiny. Tento projekt bude zaměřen na vazbu následujících komplexů na DNA: (1) oxaliplatinu, (2) RAPTA-B komplex a (3) Os(II) a Rh(III) analogy RAPTA complexů. DNA bude v prvním kroku reprezentována pomocí ds(pGpG) dinucleotidu, v dalším kroku bude zahrnut ještě i vedlejší pár bazí. Pomocí DFT a ab initio metod získáme informace na molekulární úrovni, které nejsou k dispozici z experimentů, zvláště data o (de)stabilizaci tranzitních stavů a jejich závislosti na sekvenci, data o průběhu lokálních změn v sekundární struktuře DNA během vazby komplexů a data o vlivu navázaného komplexu na párové interakce. U uvažovaných komplexů bude také vypočítána vazebná selektivita vzhledem k proteinům.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Sound result on the interaction of antitumor complexes of Pt and Ru with biomolecules were obtained, along with further results. The work was published in high-quality journals and elsewhere. The project solution and the report show a high degree of professionality.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 20, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
5,435 thou. CZK
Public financial support
5,435 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK