Role of retroviral matrix protein in virus particle targeting and interaction with plasma membrane.
Project goals
Study of retroviruses has been mostly oriented on strategies in treatment of HIV infected patients and use of retroviruses in gene delivery. It also led to discoveries of cancer genes and reverse transcriptase that opened new ways in molecular biology. In this project, we will focus on late stage of the virus life cycle by studying the interactions of retroviral structural proteins or whole viral particles with the cytoplasmic membrane. We aim to study the retroviral matrix protein (MA), a key determinant for the interaction of viral proteins with cellular transport machinery and the plasma membrane. We propose to use NMR spectroscopy to explain structural changes triggered by the interaction of MA with the phosphoinositide components of plasma membrane. Another approach, mimicking the plasma membrane, includes the use of phosphoinositide liposomes to study their interactions with soluble MA or in vitro prepared virus-like particles. We will also study interactions of MA with cellular factors identified by yeast two-hybrid screening.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P302-12-1895
Alternative language
Project name in Czech
Role retrovirového matrixového proteinu při transportu virové částice a její interakci s cytoplasmatickou membránou.
Annotation in Czech
Studium retrovirů je orientováno především na strategie léčby HIV infikovaných pacientů a použití retrovirů pro vnášení genů. Retrovirologické experimenty vedly také k objevu onkogenů a reversní transkriptázy, což otevřelo nové cesty v molekulární biologii. Navrhujeme zaměřit se v tomto projektu na mechanismus interakcí virových proteinů nebo celých virových částic s membránou hostitelské buňky. Chceme studovat retrovirový matrixový protein (MA), jako hlavního prostředníka interakce virových proteinů se složkami buněčného transportu a cytoplasmatickou membránou. Využitím NMR spektroskopie chceme vysvětlit strukturní změny vyvolané interakcí MA s fosfoinositoly cytoplasmatické membrány. Dalším přístupem bude simulace cytoplasmatické membrány pomocí fosfoinositidových liposomů pro studium jejich interakce s rozpustným MA nebo s in vitro připravenými viru-podobnými částicemi. Rovněž budeme studovat interakce MA s buněčnými faktory identifikovanými pomocí kvasinkového dvojhybridního systému.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The goals of the project based on the study of the role of retroviral matrix protein in virus particle targeting and interaction with plasma membrane were fulfilled in an excellent way, coherent with the initial objectives. Application potential of the project highlighted analogies between Mason-Pfizer monkey virus and HIV-1. Original results were published in 10 papers in prestigious journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
8,835 thou. CZK
Public financial support
8,835 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
8 835 CZK thou.
Public support
8 835 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EE - Microbiology, virology
Solution period
01. 01. 2012 - 31. 12. 2016