Shaping the genome: How environmental factors affect the DNA content evolution in populations of planktonic algae?
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
SGA0202300005
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05546O
Alternative language
Project name in Czech
Formování genomu: Jak mohou environmentální faktory ovlivnit evoluci velikosti genomu v populacích planktonních řas?
Annotation in Czech
Eukaryotické organismy vykazují obrovskou variabilitu ve velikosti genomu. I když jsou známy mnohé souvislosti velikosti genomu s různými buněčnými a fyziologickými vlastnostmi, evoluční příčiny a důsledky této variability zůstávají obecně neznámé. V předkládaném projektu budu testovat adaptivní potenciál velikosti genomu u jednobuněčných řas zlativek, z nichž mnohé disponují značnými vnitrodruhovými rozdíly v obsahu jaderné DNA. Budu kvantifikovat vnitrodruhovou kompetici kmenů s odlišným obsahem DNA v různých ekologických podmínkách, v neomezeném a (živinami / teplotou) omezeném prostředí. Budu také zjišťovat evoluční mechanismy vzniku variability ve velikosti genomu u druhu S. petersenii. Pomocí srovnávací genomiky charakterizuji části genomu, které způsobily rozdíly v množství DNA mezi jedinci. Tento projekt zlepší naše chápání evoluce velikosti genomu a jejího možného adaptivního potenciálu. Já si rozšířím znalosti v evoluční genomice a ekologii a získám větší vědeckou nezávislost díky školení od renomovaného vědce Dr. Stelzera na Univerzitě v Innsbrucku.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10617 - Marine biology, freshwater biology, limnology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
DA - Hydrology and limnology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Jun 22, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GN-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
4,865 thou. CZK
Public financial support
4,865 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK