Analysis of replication and DNA damage response in plants deficient in accurate chromatin assembly
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 14 (SGA0201300006)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-11563P
Alternative language
Project name in Czech
Analýza replikace a odezvy na poškození DNA u rostlin postrádající správné sestavování chromatinu
Annotation in Czech
Správné sestavování chromatinu je v buňce regulováno za účasti mnoha chromatin-remodelujících faktorů a histonových chaperonů, z nichž jeden z nejdůležitějších je tzv. Chromatin Assembly Faktor 1 (CAF1). Jde o vysoce konzervovaný komplex složený typickyze tří podjednotek, který se podílí se na sestavování H3/H4 histonů do nukleozomů během replikace. Funkce CAF1 byly také prokázány v DNA opravách; u savců totiž interaguje s Ku70, klíčovým proteinem opravné dráhy nehomologního spojování konců (NHEJ). CAF1 je u Arabidopsis složen ze tří podjednotek - FAS1 (FASCIATA 1), FAS2 (FASCIATA 2) and MSI (MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1). Zatímco delecí MSI1 získáme neživotaschopné rostliny, delece podjednotek FAS1 nebo FAS2 způsobuje poškození sestavování chromatinuspojené se specifickou ztrátou některých repetic - telomer a rDNA. Mechanizmus, kterým jsou tyto ztráty uskutečňovány není znám, nicméně pravděpodobně zahrnuje replikační a reparační procesy. Detailní popis těchto dvou mechanizmů s ohledem na rDNA sekvence u FASCIATA mutantů je cílem tohoto projektu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
It was found that the active copies 45SrDNA that are systematically lost in chromatine fas mutants are associated with an increased amount of DNA damage. On the other side, in fas mutants with restored CAF1 function the organization of individual nucleolar organizers changed compared to fas mutants and wt plants. One papers and one review is presented as outputs of this project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,603 thou. CZK
Public financial support
2,603 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK