Ecology of the dominant bacterial taxa in the Picea abies forest soil
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-09040P
Alternative language
Project name in Czech
Ekologie dominantních bakterií v půdě smrčin
Annotation in Czech
Bakterie v půdách jehličnatých lesů poskytují klíčové ekosystémové služby a mají zásadní úlohu v půdních procesech jako je dekompozice a geochemické cykly prvků. Přestože recentní studie zkoumaly vztah mezi bakteriálními společenstvy a environmentálními parametry, porozumění funkcím bakteriálních společenstev, tak jak je popisují metody molekulární biologie, je dosud neúplné. Z předchozích studií vyplývá, že půdy s dominantním Picea abies obsahují vysoce rozmanité celkové i aktivní společenstvo bakterií. Tento projekt má za cíl isolaci a fyziologickou charakterizaci těch bakteriálních taxonů, které patří mezi nejčetnější. Měl by také poskytnout genomové sekvence vybraných isolátů a údaje o jejich expresi ve vztahu k důležitým environmentálním funkcím půdy pomocí kombinace transkriptomiky, proteomiky, metatranskriptomiky a metaproteomiky. Výsledky projektu by měly přispět k rozšíření informací o rolích, které v prostředí půd jehličnatých lesů hrají kvantitativně dominantní bakteriální taxony.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The understanding on the soil bacterial communities in temperate mountainous coniferous forests was improved. For the first time, the gene expression of abundant strains was analyzed in the real soil environment. The project has shown that the expression levels of ribosomal proteins were correlated with bacterial ecological strategies (r/k), which seem to be conserved through bacterial phylogeny.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
3,594 thou. CZK
Public financial support
3,594 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK