Identification of cis-acting signal and trans-acting proteins involved in DNA encapsidation and viral assembly of mouse polyomavirus.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 10 (SGA02010GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P302-10-P118
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace enkapsidačního signálu a proteinů zúčastněných při enkapsidaci DNA v průběhu virové morfogeneze myšího polyomaviru.
Annotation in Czech
Tento projekt je zaměřen na proces tvorby virionů u myšího polomaviru. Cílem předkládaného projektu je identifikovat v rámci virového genomu signální sekvence nutné pro jeho enkapsidaci a protein/y účastnící se vzniku virionu. Experimentální systém pro identifikaci těchto elementů je založen na schopnosti psedovirionů produkovaných ve speciálně navržené buněčné linii transdukovat reportérový gen. V projektu je navrženo několik experimentálních metod pro ověření nezbytnosti takto identifikovaných elementů pro encapsidaci virového genomu. Mezi metody sloužící k potvrzení vazby identifikovaného proteinu na enkapsidační signální sekvenci patří místně specifická mutageneze enkapsidační sekvence, test změny mobility EMSA (electrophoretic mobility shift assay) a chromatinová imunoprecipitace. Konkrétní role identifikovaného protein (nebo proteinů) při vzniku virionu bude osvětlena pomocí série experimentů v buněčné linii s regulovatelnou hladinou tohoto proteinu připravenou pomocí technologie RNA interference. Kromě toho bude vyhodoncena i nezbytnost nově identifikovaných elementů v návrhu systému pro dopravu genů do savčích buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has shown that in different polyomaviruses exist variablemechanisms for DNA encapsidation. In mouse polyomavirus, contrary to expectations, specific encapsidation signal has not been detected..A new recombination system was developed. for production of mutants Two papers were published in renowned journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 8, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,298 thou. CZK
Public financial support
2,298 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK