Biophysical properties of the (guanine+cytosine) blocks and the (adenine+thymine) blocks in the human chromosome molecules of DNA
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Biofyzikální vlastnosti úseků (guanin+cytosin) a úseků (adenin+thymin) v molekulách DNA lidských chromozomů
Annotation in Czech
V molekulách DNA lidských chromozómů nalezneme nejdelší úseky (G+C) a (A+T). Určíme jejich biofyzikální vlastnosti, které pomohou zjistit, jak tyto oblasti fungují při transkripci a replikaci. Zaměříme se na zjištění posloupností nukleotidů, které vnášejí do DNA vlastnosti typické pro RNA, protože tyto oblasti se pravděpodobně vyvinuly v dávné minulosti a dodnes plní v genomu klíčové funkce. Dále se zaměříme na oblasti citlivé k poškození ultrafialovým světlem. Této citlivosti využijeme k analýze jejichsekundární struktury. Vyvineme metodiku pro modelování terciárních struktur celých molekul DNA lidských chromozómů a identifikaci základních prostorových tvarů a domén, které se v nich vyskytují. Syntéza poznatků získaných v tomto projektu o primární, sekundární a terciární struktuře molekul DNA lidských chromozómů pomůže pochopit, jak tyto molekuly vznikly, jak fungují a jak v nich dochází k patologickým změnám.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
A method has been developed to search for RNA-like regions in genomic DNA. A software has been created to simulate tertiary structures of genomic molecules of DNA. The longest (A+T) and (G+C) regions were identified in genomes.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-IA-U/03:3
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
6,327 thou. CZK
Public financial support
3,013 thou. CZK
Other public sources
2,476 thou. CZK
Non public and foreign sources
838 thou. CZK