Vasculature quantification by stereology and 3D image analysis for evaluation of the effect of proton or Iron-56 irradiation on blood supply of eye and brain tissues
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 3 (SMSM2013LH3)
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-16744/2013
Alternative language
Project name in Czech
Kvantitativní měření vaskulatury stereologií a 3D analýzou obrazu pro hodnocení vlivu protonového záření či proudu těžkých iontů železa na krevní zásobení tkání oka a mozku
Annotation in Czech
Cílem projektu je vývoj nových interdisciplinárních přístupů ke kvantitativní analýze vaskulatury za účelem studia krevního zásobení tkání oka a mozku po jejich vystavení různým dávkám protonového záření či proudu těžkých iontů železa. Budou vyvinuty speciální metody pro předzpracování, segmentaci a analýzu trojrozměrných (3D) digitálních obrazů vzorků cévnatky a dalších tkání oka a mozku, získaných konfokálním mikroskopem či optickou projekční tomografií (OPT). Dále budou vyvinuty metody pro měření geometrických charakteristik vaskulatury, zejména krevních vlásečnic, a metody pro jejich 3D rekonstrukci. Bude využita kombinace analýzy obrazu, stereologie, prostorové statistiky a 3D rekonstrukcí, aplikovaná na hodnocení biomedicínských obrazových dat zkonfokálního mikroskopu a OPT s konkrétním výstupem v radiobiologickém výzkumu spojeném s léčbou rakoviny aplikací protonového záření a s vyhodnocením rizik pro tkáně oka a mozku kosmonautů při jejich cestách do vesmíru.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project aims, i.e. development of new interdisciplinary approaches to quantitative analysis of vasculature in order to study blood supply of eye and brain tissues, were met. Special methods for pre-processing, segmentation, analysis and reconstruction of 3D images acquired by confocal microscopy or optical projection tomography were developed. Results were published in 6 scientific papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Oct 9, 2017
Finance
Total approved costs
1,694 thou. CZK
Public financial support
1,694 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK