Molecular epidemiology of hepatitis C virus in the Czech Republic
Project goals
Set up of sequence analysis of PCR fragments of HCV genome isolates. Obtaining of basic data about variability of HCV in infected persons from low-risk group of blood donors and high-risk group of injection drug users. Set up of database of partial sequences of HCV isolates from Czech Republic. Mapping of geographical distribution of types, subtypes and variants of HCV in low and high-risk groups. Analysis of parcial HCV RNA variability in low-risk population of blood donors in interval of 5 years. Useof molecular epidemiology for analysis of outbreaks of HCV infection in health care facilities and in person-to-person transmission in professional risk cases
Keywords
Hepatitis CepidemiologyHCVNS5 regiongenotypesblood donorsIDUsequencing
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Branch programm of research of the Ministry of Health
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví 3 (SMZ02006NR)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NR9044-3/2006
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární epidemiologie viru hepatitidy C v ČR
Annotation in Czech
Zavedení sekvenační analýzy úseků genomu viru hepatitidy C získaných metodou RT PCR ze sér infikovaných osob. Získání základních údajů o variabilitě HCV v nízkorizikové skupině infikovaných dárců krve a vysoce rizikové skupině injekčních uživatelů drog Vytvoření databáze parciálních sekvencí genomu HCV z izolátů z ČR, jako referenčního souboru pro srovnávací analýzu nových izolátů. Zjištění distribuce typů a subtypů HCV ve skupinách s nízkým a vysokým rizikem infekce HCV. Analýza sekvencí soubor HCV RNApozitivních sér z nízkorizikové populace v závislosti na době sběru. Budou sledovány změny struktury genomu HCV izolátů v časovém intervalu 5 let. Využití ME při analýze případů epidemických výskytů VHC (hledání zdrojů a způsobů šíření) zejména ve zdravotnických zařízeních, vyhodnocení možností sekvenační analýzy při studiu přenosu HCV mezi konkrétními osobami (profesionání a forenzní případy)
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Original genotype prevalence data in the population of blood donors and intravenous drug users in the Czech republic were gained. Czech database of partial nucleotide sequences from NS5 region of HCV for molecular epidemiological study was created.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 5, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-MZ0-NR-U/09:2
Data delivery date
Apr 27, 2011
Finance
Total approved costs
3,265 thou. CZK
Public financial support
3,028 thou. CZK
Other public sources
103 thou. CZK
Non public and foreign sources
134 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 265 CZK thou.
Public support
3 028 CZK thou.
92%
Provider
Ministry of Health
CEP
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008