All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Integrated genomics for advanced diagnostics of non-Hodgkin lymphomas and for decifering mechanisms of drug resistence

Public support

  • Provider

    Ministry of Health

  • Programme

  • Call for proposals

    SMZ0202300001

  • Main participants

    Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    NU23-03-00172

Alternative language

  • Project name in Czech

    Integrované genomické postupy pro pokročilou diagnostiku nehodgkinských lymfomů a pro určení mechanismů látkové rezistence

  • Annotation in Czech

    Nehodgkinské lymfomy (NHL) představují nejčastější hematologické malignity s incidencí cca 16 / 100 tisíc obyvatel / rok. Současné diagnostické postupy u pacientů s NHL jsou založeny na konvenční imunohistochemické analýze a četných testech, které mají za cíl stanovit klonalitu lymfomových buněk a detekovat vybrané molekulární aberace včetně somatických mutací, chromozomálních translokací a copy number variant. Lymfom z plášťových buněk (MCL) je vzácný typ B-NHL zahrnující cca 6-7% všech NHL. Na rozdíl od klasického MCL, tzv. non-nodální MCL (nnMCL) představuje indolentní variantu choroby představující cca 10% všech MCL. Pacienti s nnMCL mají obvykle infiltraci kostní dřeně, leukemizaci a zvětšenou slezinu (ale nemají postižené uzliny) a často nevyžadují bezprostřední zahájení léčby, ale mohou být pouze sledování. V tomto projektu hodláme zavést tzv. EuroClonality NGS DNA capture (NDC) panel do rutinní diagnostiky pacientů s NHL na I.interní klinice- hematologie VFN a 1.LF UK (cca 200 nových pacientů s NHL / rok). EuroClonality NDC panel umožňuje současné stanovení klonality a detekci mutací, chromozomálních translokací a copy number aberací 72 genů relevantních pro NHL. V rámci druhého cíle hodláme využít celoexomovou sekvenaci (WES) k analýze mutačního profilu 25 pacientů s nově dg. MCL s vysokým rizikem dle indexu MIPI, kteří neprodělali relaps choroby minimálně 5 let od stanovení diagnózy. Tento soubor hodláme porovnat se souborem již osekvenovaných 25 pacientů s MCL, kteří prodělali časný relaps (medián PFS 9 měsíců). V rámci posledního cíle využijeme metodu jednobuněčného sekvenování (single-cell RNA sequencing) a WES ke studiu klonálního vývoje pacientů s nnMCL při diagnóze, během observace a před zahájením léčby. Projekt přispěje ke zlepšení diagnostiky a prognostikace pacientů s nově dg. NHL a k hlubšímu poznání významu genetických aberací pro prognózu pacientů s MCL.

Scientific branches

  • R&D category

    AP - Applied research

  • OECD FORD - main branch

    30205 - Hematology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    FD - Oncology and haematology

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    May 1, 2023

  • Realization period - end

    Dec 31, 2026

  • Project status

    B - Running multi-year project

  • Latest support payment

    Apr 28, 2023

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP24-MZ0-NU-R

  • Data delivery date

    Feb 21, 2024

Finance

  • Total approved costs

    18,226 thou. CZK

  • Public financial support

    18,226 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK