Unknown cause of DFNB1 deafness in patients with only one pathogenic GJB2 gene mutation – complex elucidation by new molecular genetic approaches.

Project name in Czech
Neznámá příčina DFNB1 hluchoty u pacientů s pouze jednou patogenní mutací v GJB2 genu – komplexní analýza pomocí nových molekulárně genetických metod.
Annotation in Czech
Naše skupina zjistila, že mutace v GJB2 genu jsou příčinou časné nesyndromové hluchoty u téměř 40 % českých pacientů. U významné části neslyšících pacientů je však nalézána pouze jedna patogenní mutace v kódující části GJB2 genu a příčina tím zůstává neobjasněna. V tomto projektu bude hledána druhá, stále neznámá mutace, zodpovědná za sluchovou poruchu u těchto pacientů. DNA od těchto neslyšících heterozygotů s pouze jednou patogenní mutací v GJB2 genu bude vyšetřena na přítomnost malých chromozomálních přestaveb, zejména delecí na chromozomu 13, v oblasti GJB2 a GJB6 genu, pomocí metody aCGH s využitím čipů s vysokým rozlišením. Jako negativní kontroly budou použity vzorky od neslyších c.35delG homozygotů. Nález případné opakující se delece či přestavby velikosti stovek až tisíců nukleotidů by mohl objasnit příčinu hluchoty u řady pacientů a rodin celosvětově. Nebude-li nalezena delece bude provedeno celoexomové, či celogenomové sekvenování u přibližně 20 těchto neslyšících heterozygotů pro pouze jednu patogenní mutaci. Cílem je nalezení druhé kausální mutace.

R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FF - ENT (ie. ear, nose, throat), ophthalmology, dentistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches (according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) 10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3) 10605 - Developmental biology 10608 - Biochemistry and molecular biology 10609 - Biochemical research methods 30101 - Human genetics 30206 - Otorhinolaryngology 30207 - Ophthalmology 30208 - Dentistry, oral surgery and medicine

Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The authors analyzed patients with hereditary deafness having heterozygous pathogenic GJB2 mutation in order to identify additional mutations in this locus explaining the phenotype and enabling improved diagnostics and genetic counseling. No such mutations were identified and thus initial hypothesis had to be refused. Using whole-exome sequencing, mutations in other parts of the genome were identified in about 19% of patients. The main results represent the advancement of knowledge in the genetics area and maybe eventually applied in further study of the etiology of hereditary deafness. Results were published in publicly accessible scientific journals with impact factor. The quantity and quality of publication endpoints is in agreement with planned goals in the project application. However, the external referee criticizes that the subject of two out of three published works does not fall into the initial project aims. The cumulative impact factor of all published works is 9.7. Establis

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jun 25, 2021

Similar projects(10)