Variants of unknown significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations

Project name in Czech
KLASIFIKACE VARIANT NEJASNÉHO VÝZNAMU V GENU CHEK2 A FENOTYPOVÁ CHARAKTERIZACE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ U NOSIČŮ PATOGENNÍCH VARIANT
Annotation in Czech
Gen CHEK2 kóduje kinázu CHK2, fosforylující řadu intracelulárních proteinů v odpovědi na poškození DNA. Patogenní, zárodečné mutace v CHEK2 zvyšují riziko vzniku karcinomu prsu a některých dalších nádorů. Analýza CHEK2 je v současnosti součástí genetické analýzy nádorové predispozice v ČR. V předchozích analýzách jsme mutace v CHEK2 nalezli u více jak 6,5% nemocných s ca prsu a/nebo ovaria a ukázali jsme, že většinu alterací tvoří varianty nejasného významu (VUS). Pro jejich funkční klasifikaci jsme vyvinuli unikátní systém založený na kvantifikaci fosforylace KAP1 katalyzované CHK2 v buněčné linii. Ve studii uzpůsobíme modelový systém pro vysokokapacitní analýzu a provedeme klasifikaci všech VUS v CHEK2 detekovaných spolupracujícími pracovišti u pacientů v ČR a zahraničí. Výsledky studie zvýší diagnostickou výtěžnost analýz nádorové predispozice a umožní charakterizovat pacienty s patogenními mutacemi CHEK2, což je základním předpokladem pro genetické poradenství v rodinách nosičů, stanovení rizika nádorů asociovaných s mutacemi v genu CHEK2 a racionalizaci preventivních opatření.

R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - secondary branch
30204 - Oncology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology

Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
According to the documentation provided, the work (and the use of funds) was carried out within the approved conditions, and the original plan was even significantly exceeded in terms of the number of CHEK2 variants tested; also the collected cohort of patients and controls is very large. The results of the grant can be used in further research and clinical practice. The most important results obtained in an extensive international collaboration were published in the prestigious Clinical Cancer Research (a journal with IF in the first decile of the field). Czech authors are the first and corresponding authors of this important international publication. The fact that 2 publications from the beginning of the project solution were published by the MDPI publishing house does not reduce the quality of the grant outputs. The requirement for exclusive AZV dedication is met. The solution of the project can be considered very successful.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Oct 18, 2023

Similar projects(10)