DNA microchip for the direct diagnosis of pathogenic bacteria.
Project goals
The main objective of the project is function sample of the Diagnostics electrochemical system employing the PNA (Peptide Nucleic Acid) probes for identification of the bacterial DNA. A key prerequisite is to achieve high resolution allowing rapid non-invasive diagnosis of the urine samples from a patient's. During the year 2017 the DNA probes will be designed and tested on the samples, representing the target sequence of the selected group of pathogenic bacteria. Another aim in 2018 will be focused on the preparation and testing of the PNA probes from the preselected DNA sequences and testing of the electrochemical detection method using standardized samples of selected pathogenic bacteria. The ultimate aim in 2019 will be focused on the verification of the system on the clinical samples.
Keywords
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
Programme of applied research and experimental development EPSILON
Call for proposals
EPSILON 2 (STA02017TH02)
Main participants
BIOPHARM, Výzkumný ústav biofarmacie a veterinárních léčiv a.s.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
2016TH02010657
Alternative language
Project name in Czech
DNA mikročip pro přímou diagnostiku patogenních bakterií.
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je vytvoření funkčního vzorku diagnostického elektrochemického systému k identifikaci DNA bakterií pomocí PNA sond (Peptide Nucleic Acid). Klíčovým předpokladem bude dosažení dostatečné citlivosti metody, která by umožnila provádět rychlou neinvazní diagnostiku přímo ze vzorku moči pacienta. Prvním postupným cílem v roce 2017 bude navržení a příprava DNA sond a testování jejich parametrů na vzorcích standardů, reprezentujících cílové sekvence vybrané skupiny patogenních bakterií. Dalším cílem v roce 2018 bude příprava a testování PNA sond z vybraných testovaných sekvencí a zavedení elektrochemického způsobu detekce na standardizovaných vzorcích vybraných patogenních bakterií. Konečným cílem v roce 2019 bude ověřit funkčnost tohoto systému na klinických vzorcích.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
JB - Sensors, detecting elements, measurement and regulation
CEP - another secondary branch
FE - Other fields of internal medicine
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
20201 - Electrical and electronic engineering
30101 - Human genetics
30217 - Urology and nephrology
30218 - General and internal medicine
30219 - Gastroenterology and hepatology
30220 - Andrology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
These are preliminary data, the project evaluation hasn´t proceeded yet.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 28, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP20-TA0-TH-U/17:1
Data delivery date
Feb 20, 2020
Finance
Total approved costs
5,888 thou. CZK
Public financial support
3,480 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
2,408 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
5 888 CZK thou.
Public support
3 480 CZK thou.
59%
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2017 - 31. 12. 2019