Molecular approach to the identification of fish

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027022%3A_____%2F17%3A00000679" target="_blank" >RIV/00027022:_____/17:00000679 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2017.pdf" target="_blank" >http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2017.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Autentizace ryb pomocí molekulárně-biologických přístupů

Original language description

Určování druhu ryby je běžně založeno na morfologických znacích. S rostoucí mírou zpracování ryb do produktů potravinářského průmyslu nebo komplexnějších pokrmů v rámci gastronomie však možnost takovéhoto určení zásadním způsobem klesá. Rovněž dovoz mořských ryb do vnitrozemských států, jakým je i ČR, se ve velké míře realizuje formou zmrazených bloků komprimovaného a často již částečně opracovaného rybího masa. Morfologické znaky k rozlišení jednotlivých druhů ryb ani v tomto případě tedy nelze použít. Dostupnost metody umožňující druhové určení rybího masa ve vzorku, bez ohledu na jeho velikost, intaktnost či zpracování, je nezbytné. Molekulárně-biologické metody založené na PCR patří vzhledem ke své vysoké citlivosti a specifitě mezi techniky vhodné pro druhové určení syrových i technologicky opracovaných ryb a to i v komplexní potravině. Analýza je prováděna prostřednictvím amplifikace jaderného genu kódujícího významný rybí alergen, parvalbumin. V předkládané práci byly v rámci kvantitativní qPCR navrženy a otestovány primery spolu s fluorescenčně značenou sondou komplementární k druhému intronu genu kódujícímu parvalbumin pražmy zpěvné (Spondyliosoma cantharus). Specifita navrhovaného systému byla potvrzena na panelu 19 ryb zahrnujícím nejvýznamnější část spektra obchodovaných a nabízených druhů, například: kapr (Cyprinus carpio), lín (Tinca tinca), tilapie (Oreochromis niloticus) atd. Efektivita qPCR byla zjištěna sestrojením kalibrační křivky s využitím DNA různé koncentrace. Bylo potvrzeno, že qPCR je vhodná a vysoce efektivní metoda pro druhovou identifikaci pražmy zpěvné.

Czech name

Autentizace ryb pomocí molekulárně-biologických přístupů

Czech description

Určování druhu ryby je běžně založeno na morfologických znacích. S rostoucí mírou zpracování ryb do produktů potravinářského průmyslu nebo komplexnějších pokrmů v rámci gastronomie však možnost takovéhoto určení zásadním způsobem klesá. Rovněž dovoz mořských ryb do vnitrozemských států, jakým je i ČR, se ve velké míře realizuje formou zmrazených bloků komprimovaného a často již částečně opracovaného rybího masa. Morfologické znaky k rozlišení jednotlivých druhů ryb ani v tomto případě tedy nelze použít. Dostupnost metody umožňující druhové určení rybího masa ve vzorku, bez ohledu na jeho velikost, intaktnost či zpracování, je nezbytné. Molekulárně-biologické metody založené na PCR patří vzhledem ke své vysoké citlivosti a specifitě mezi techniky vhodné pro druhové určení syrových i technologicky opracovaných ryb a to i v komplexní potravině. Analýza je prováděna prostřednictvím amplifikace jaderného genu kódujícího významný rybí alergen, parvalbumin. V předkládané práci byly v rámci kvantitativní qPCR navrženy a otestovány primery spolu s fluorescenčně značenou sondou komplementární k druhému intronu genu kódujícímu parvalbumin pražmy zpěvné (Spondyliosoma cantharus). Specifita navrhovaného systému byla potvrzena na panelu 19 ryb zahrnujícím nejvýznamnější část spektra obchodovaných a nabízených druhů, například: kapr (Cyprinus carpio), lín (Tinca tinca), tilapie (Oreochromis niloticus) atd. Efektivita qPCR byla zjištěna sestrojením kalibrační křivky s využitím DNA různé koncentrace. Bylo potvrzeno, že qPCR je vhodná a vysoce efektivní metoda pro druhovou identifikaci pražmy zpěvné.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10608 - Biochemistry and molecular biology

Project

—

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2017

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů