Further analysis of VNTR and MIRU in the genome of Mycobacterium avium complex, and application to molecular epidemiology of isolates from South America
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F05%3A06000063" target="_blank" >RIV/00027162:_____/05:06000063 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Further analysis of VNTR and MIRU in the genome of Mycobacterium avium complex, and application to molecular epidemiology of isolates from South America
Original language description
All members of Mycobacterium avium complex (MAC) are serious pathogens for humans and animals. The aim of this study was to look for and analyze VNTR-MIRU loci in the genome of MAC. In the present study, we identified 22 novel VNTR-MIRU by using TandemRepeat software: five with a structure simlar to MIR and 17 without MIRU structure. In conclusion, some of the VNTR-MIRU loci identified were useful to differentiate M. avium subspecies avium but not M. avium subspecies paratuberculosis.
Czech name
Další analýza genomu izolátů komplexu Mycobacterium avium metodami VNTR a MIRU a použití molekulární epidemiologie u izolátů z Jižní Ameriky
Czech description
Všichni zástupci komplexu Mycobacterium avium complex (MAC) jsou významnými lidskými a zvířecími patogeny. Cílem práce bylo analyzovat VNTR-MIRU lokusy v genome of MAC. V předkládané studii bylo identifikováno 22 nových VNTR-MIRU při použití softwaruTandem Repeat: pět mělo a 17 němělo podobnou strukturu MIRU. Závěrem je možné říci že se identifikací lokusů metodou VNTR-MIRU podařilo diferencovat M. avium subspecies avium ale nikoliv M. avium subspecies paratuberculosis.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Veterinary Microbiology
ISSN
0378-1135
e-ISSN
—
Volume of the periodical
110
Issue of the periodical within the volume
3-4
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
17
Pages from-to
221-237
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—