Methods for detection of plasmid-bound colistin resistance mediated by mcr genes
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F21%3A10437796" target="_blank" >RIV/00216208:11130/21:10437796 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/00064203:_____/21:10437796
Result on the web
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=aKmWk-8mpx" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=aKmWk-8mpx</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metody detekce plazmidově vázané kolistinové rezistence mediované geny mcr
Original language description
Úvod: Kolistin je rezervním antibiotikem používaným pro léčbu infekcí způsobených multirezistentními gramnegativními patogeny. Plazmidově vázaná kolistinová rezistence mediovaná geny mcr představuje zvýšené riziko šíření a její výskyt by měl být monitorován. Cílem této práce je diskutovat možné metody detekce a jejich spolehlivost pro vyhledávání tohoto typu rezistence. Materiál a metody: Spolehlivost diskové difuzní metody, Rapid Polymyxin NP testu a dvou typů gradientových testů pro vyhledávání rezistence ke kolistinu mediované geny mcr byla evaluována na 16 humánních a dvou referenčních kmenech Escherichia coli (ke kolistinu citlivé a rezistentní s chromozomální mutací nebo nesoucí gen mcr-1). Referenční metodou pro stanovení rezistence ke kolistinu byla mikrodiluční metoda. Výsledky: Pro cílené vyhledávání kmenů rezistentních ke kolistinu je vhodné použít selektivní médium s přídavkem kolistinu. U získaných izolátů je nutné vždy suspektní kolistinovou rezistenci konfirmovat spolehlivou metodou. Porovnávané gradientové metody i Rapid Polymyxin NP test vykazovaly 100% shodu s referenční mikrodiluční metodou. Při použití diskové difuzní metody byl jednoznačně a správně vyhodnocen výsledek pouze v 11 % a 33 % případů při použití 10 μg a 50 μg disku. Jedná se tedy o metodu nevhodnou pro vyhledávání kolistinové rezistence. Závěr: Prospektivní prevalenční studie střevního nosičství u hospitalizovaných pacientů a cestovatelů v České republice prozatím nenaznačují rozšíření kmenů s plazmidově kódovanou rezistencí ke kolistinu mediovanou geny mcr. Nicméně vysoká prevalence kmenů nesoucích geny mcr ve výrobcích ze syrového masa představuje riziko expozice pro jejich konzumenty. Při rutinním mikrobiologickém vyšetření nelze předpokládat, že ke kolistinu rezistentní kmeny nesoucí geny mcr budou odhaleny bez cíleného vyhledávání s použitím spolehlivých, ale nákladných metod. Vhodnou alternativní metodou pro aktivní vyhledávání rezistence ke kolistinu je selektivní kultivace na půdách s kolistinem s ověřením rezistence u zachycených izolátů.
Czech name
Metody detekce plazmidově vázané kolistinové rezistence mediované geny mcr
Czech description
Úvod: Kolistin je rezervním antibiotikem používaným pro léčbu infekcí způsobených multirezistentními gramnegativními patogeny. Plazmidově vázaná kolistinová rezistence mediovaná geny mcr představuje zvýšené riziko šíření a její výskyt by měl být monitorován. Cílem této práce je diskutovat možné metody detekce a jejich spolehlivost pro vyhledávání tohoto typu rezistence. Materiál a metody: Spolehlivost diskové difuzní metody, Rapid Polymyxin NP testu a dvou typů gradientových testů pro vyhledávání rezistence ke kolistinu mediované geny mcr byla evaluována na 16 humánních a dvou referenčních kmenech Escherichia coli (ke kolistinu citlivé a rezistentní s chromozomální mutací nebo nesoucí gen mcr-1). Referenční metodou pro stanovení rezistence ke kolistinu byla mikrodiluční metoda. Výsledky: Pro cílené vyhledávání kmenů rezistentních ke kolistinu je vhodné použít selektivní médium s přídavkem kolistinu. U získaných izolátů je nutné vždy suspektní kolistinovou rezistenci konfirmovat spolehlivou metodou. Porovnávané gradientové metody i Rapid Polymyxin NP test vykazovaly 100% shodu s referenční mikrodiluční metodou. Při použití diskové difuzní metody byl jednoznačně a správně vyhodnocen výsledek pouze v 11 % a 33 % případů při použití 10 μg a 50 μg disku. Jedná se tedy o metodu nevhodnou pro vyhledávání kolistinové rezistence. Závěr: Prospektivní prevalenční studie střevního nosičství u hospitalizovaných pacientů a cestovatelů v České republice prozatím nenaznačují rozšíření kmenů s plazmidově kódovanou rezistencí ke kolistinu mediovanou geny mcr. Nicméně vysoká prevalence kmenů nesoucích geny mcr ve výrobcích ze syrového masa představuje riziko expozice pro jejich konzumenty. Při rutinním mikrobiologickém vyšetření nelze předpokládat, že ke kolistinu rezistentní kmeny nesoucí geny mcr budou odhaleny bez cíleného vyhledávání s použitím spolehlivých, ale nákladných metod. Vhodnou alternativní metodou pro aktivní vyhledávání rezistence ke kolistinu je selektivní kultivace na půdách s kolistinem s ověřením rezistence u zachycených izolátů.
Classification
Type
J<sub>SC</sub> - Article in a specialist periodical, which is included in the SCOPUS database
CEP classification
—
OECD FORD branch
30303 - Infectious Diseases
Result continuities
Project
<a href="/en/project/NV18-09-00254" target="_blank" >NV18-09-00254: Sentinel testing survey of plasmid-mediated (transferable) colistin resistance among Enterobacteriaceae in the Czech Republic</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2021
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Klinická mikrobiologie a infekční lékařství
ISSN
1211-264X
e-ISSN
—
Volume of the periodical
27
Issue of the periodical within the volume
4
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
7
Pages from-to
128-134
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
2-s2.0-85125429029