Detection of Fusarium using the PCR Method

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216275%3A25310%2F05%3A00003162" target="_blank" >RIV/00216275:25310/05:00003162 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Detection of Fusarium using the PCR Method

Original language description

Two methods of isolation of DNA were evaluated for successful identification of Fusarium species. The PCR was performed using primer specifically targeted to Tri5 gene. Extraction technique of DNA by Cenis (1992) and PCR procedure according to Edwards etal. (2001) was compared with DNA isolation and amplification using Plant PCR Kit. Sensitivity of the latter method was determined using reference strain of Fusarium graminearum CCM F-683 and selectivity was examined using reference cultures of differentgenera of fungi naturally occurred in food and feedstuff. Morphological features are important for species classification whereby PCR can distinguish between toxigenic and non-toxigenic fungi of Fusarium. These fungi could be detected within 2 days, while their identification by macroscopic and microscopic features takes 2-3 weeks. Thus the PCR technique has proved itself as reliable and rapid method for detection of toxigenic species of Fusarium.

Czech name

Detekce fusárií metodou PCR

Czech description

Byly optimalizovány dvě metody. Jednak postup extrakce DNA dle Cenise (1992) a postup PCR dle Edwardse et al. (2001), jednak byl pro izolaci DNA a její následnou amplifikaci použit komerční set určený pro izolaci a amplifikaci genomické DNA z listů rostlin. Použití komerčního setu se pro detekci toxinogenních plísní rodu Fusarium jeví jako spolehlivější a rychlejší. Pro optimalizaci a stanovení citlivosti reakce byla použita sbírková kultura F. graminearum CCM F - 683. Selektivita metody byla ověřena nasbírkových kulturách plísní, které se mohou vyskytovat v reálných vzorcích potravin společně s plísněmi rodu Fusarium.Polymerasová řetězová reakce byla použita pro sledování přítomnosti Tri5 genu kódujícího tvorbu trichothecenových mykotoxinů. Bylo vyšetřeno 50 vzorků potravin a krmiv. Sedm z nich bylo pozitivních na přítomnost plísní rodu Fusarium. Pět druhů rodu Fusarium vyizolovaných ze vzorků obsahovalo v DNA Tri5 gen. U jednotlivých sbírkových plísní i plísní získaných ze vzorků by

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA203%2F05%2F2106" target="_blank" >GA203/05/2106: Modern instrumentation in chemical, food and clinical analysis</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Natural Sciences

ISBN

963 661 681 7

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

7

Pages from-to

417-423

Publisher name

University of Miskolc

Place of publication

University of Miskolc

Event location

Miskolc Hungary

Event date

Aug 14, 2005

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—