A new method for the identification of PavMYB10.1 genotype responsible for a sweet cherry fruit colour
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F19%3AN0000134" target="_blank" >RIV/25271121:_____/19:N0000134 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Nová metoda identifikace genotypu PavMYB10.1 zodpovědného za barvu plodu třešní
Original language description
Barva slupky patří u třešní mezi velmi významný kvalitativní znak. Pro účely šlechtění je tedy dobré znát genotyp, který stojí za konkrétním projevem tohoto znaku. Na základě známé genetické informace je možné vyvinout molekulární markery, díky kterým můžeme už z prvních listů potomstva cíleného křížení určit, jakou barvu budou mít plody. Určování genotypu se u barvy třešní doposud provádělo klonováním a sekvenačně, protože translační faktor PavMYB10.1 zodpovědný za barvu plodu u třešní patří do genové rodiny MYB, která se obtížně analyzuje pouze pomocí PCR. Tento postup je však časově a finančně dosti náročný, proto jsme se rozhodli celý proces zjednodušit využitím metody alelické diskriminace pomocí real-time PCR. Tato metoda dokáže velmi rychle a spolehlivě determinovat genotypy PavMYB10.1 a u homozygotních genotypů je možné přesně určit barvu plodu dané odrůdy či hybridu. Námi optimalizovaná metoda je tedy využitelná v procesu MAS (selekce pomocí molekulárních markerů).
Czech name
Nová metoda identifikace genotypu PavMYB10.1 zodpovědného za barvu plodu třešní
Czech description
Barva slupky patří u třešní mezi velmi významný kvalitativní znak. Pro účely šlechtění je tedy dobré znát genotyp, který stojí za konkrétním projevem tohoto znaku. Na základě známé genetické informace je možné vyvinout molekulární markery, díky kterým můžeme už z prvních listů potomstva cíleného křížení určit, jakou barvu budou mít plody. Určování genotypu se u barvy třešní doposud provádělo klonováním a sekvenačně, protože translační faktor PavMYB10.1 zodpovědný za barvu plodu u třešní patří do genové rodiny MYB, která se obtížně analyzuje pouze pomocí PCR. Tento postup je však časově a finančně dosti náročný, proto jsme se rozhodli celý proces zjednodušit využitím metody alelické diskriminace pomocí real-time PCR. Tato metoda dokáže velmi rychle a spolehlivě determinovat genotypy PavMYB10.1 a u homozygotních genotypů je možné přesně určit barvu plodu dané odrůdy či hybridu. Námi optimalizovaná metoda je tedy využitelná v procesu MAS (selekce pomocí molekulárních markerů).
Classification
Type
J<sub>ost</sub> - Miscellaneous article in a specialist periodical
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LO1608" target="_blank" >LO1608: Research Pomological Centre</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Vědecké práce ovocnářské
ISSN
0231-6900
e-ISSN
—
Volume of the periodical
—
Issue of the periodical within the volume
26
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
9
Pages from-to
217-225
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—