PCR identification of the E.coli strains competent for production of putrescine and cadaverine

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26788462%3A_____%2F10%3A%230000375" target="_blank" >RIV/26788462:_____/10:#0000375 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
slovinština
Original language name
Stanovenie kmeňov E.coli schopných produkcie putrescínu a kadaverínu s pomocou metód PCR
Original language description
V prezentovanej práci boli s pomocou metód PCR investigované gény ornitín (speC) a lyzín (cadA) dekarboxylázy v skupine izolátov E. coli. Testovanú skupinu kmeňov predstavovalo 30 kmeňov E. coli izolovaných zo surového kravského, ovčieho a kozieho mliekaa syra, vzorky pochádzali z viacerých fariem. Na porovnanie sekvencií skúmaných génov a na analýzu konzervovaných domén a štruktúry proteínov boli použité programy ClustalW a BLAST. Analýza dostupných sekvencií génu speC odhalila existenciu génu pre speC izozým, ktorého nukleotidové usporiadanie vykazovalo homológiu v intervale 66?98% v porovnaní so sekvenciou speC. Rovnako v prípade génu cadA sme zaznamenali existenciu dvoch skupín sekvencií s homológiou približne 60 % (GenBank, cadA1, cadA2). Na základe týchto faktov sme navrhli a optimalizovali doplnkové PCR testy. 77% kmeňov bolo pozitívnych na speC, 73% na prítomnosť génu speC izozým, 60% na cadA1 a 53% na cadA2 PCR test. Produkcia jednotlivých amínov v testovaných vzorkách bola ú
Czech name
—
Czech description
—

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year
2010
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)