Two new nuclear isolation buffers for plant DNA flow cytometry: A test with 37 species

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F07%3A00305107" target="_blank" >RIV/61389030:_____/07:00305107 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Two new nuclear isolation buffers for plant DNA flow cytometry: A test with 37 species

Original language description

Background and Aims: After the initial boom in the application of flow cytometry in plant sciences in the late 1980s and early 1990s, which was accompanied by development of many nuclear isolation buffers, only a few efforts were made to develop new buffer formulas. In this work, recent data on the performance of nuclear isolation buffers are utilized in order to develop new buffers, general purpose buffer (GPB) and woody plant buffer (WPB), for plant DNA flow cytometry. Methods: GPB and WPB were used to prepare samples for flow cytometric analysis of nuclear DNA content in a set of 37 plant species that included herbaceous and woody taxa with leaf tissues differing in structure and chemical composition. The following parameters of isolated nuclei wereassessed: forward and side light scatter, propidium iodide fluorescence, coefficient of variation of DNA peaks, quantity of debris background, and the number of particles released from sample tissue. The nuclear genome size of 30 selecte

Czech name

Dva nové izolační pufry pro průtokovou cytometrii jaderné DNA u rostlin: Test u 37 druhů

Czech description

Po počátečním rozmachu průtokové cytometrie u rostlin na přelomu let 1980 a 1990, kdy byla vyvinuta řada pufrů pro izolaci jader, bylo vývoji nových pufrů věnováno jenom málo úsilí. V této práci byly stávající pufry pro průtokovou cytometrii u rostlin zdokonaleny a byly navrženy dva nové pufry s lepšími vlastnostmi: ?General purpose buffer (GPB)? a ?Woody plant buffer (WPB)?.Tyto pufry byly testovány při přípravě vzorků pro analýzu obsahu jaderné DNA průtokovou cytometrií u 37 druhů rostlin, které zahrnovaly byliny i dřeviny. Použitím nových pufrů byly získány vysoce kvalitní vzorky intaktních jader, zejména u problematických druhů. Histogramy obsahu jaderné DNA získané analýzou vzorků s pufrem GPB měly vyšší nebo stejné rozlišení jako připravené pomocí WPB. U dřevin bylo vhodnější použít pufr WPB. Ve srovnání s dříve používanými pufry bylo u většiny analyzovaných druhů dosaženo zlepšeného rozlišení obsahu jaderné DNA.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Annals of Botany

ISSN

0305-7364

e-ISSN

—

Volume of the periodical

100

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

14

Pages from-to

875-888

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—