The optimization of the molecular methods for simultaneous detection of nepoviruses Grapevine fanleaf virus and Arabis mosaic virus
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F10%3A00166466" target="_blank" >RIV/62156489:43510/10:00166466 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
OPTIMALIZACE MOLEKULÁRNÍCH METOD K SIMULTÁNNÍ DETEKCI NEPOVIRŮ RONCETU RÉVY VINNÉ (GFLV) A MOZAIKY HUSENÍKU (ArMV)
Original language description
Předmětem práce bylo optimalizovat molekulární metodu reverzně transkripční polymerázovou řetězovou reakci (RT-PCR) tak, aby umožnila detekci nepovirů roncetu révy vinné (GFLV) nebo mozaiky huseníku (ArMV) v rámci jednoho experimentu. Tyto dva nepoviry jsou si z hlediska genomu a chování v rostlinných buňkách velmi podobné, proto bylo možné nalézt v rámci genomové RNA2 obou virů vysoce konzervativní sekvence v oblasti kódující pohybový protein (2BMP). Degenerované primery z této oblasti byly nejprve testovány na izolátech s ověřenou infekcí jedním z virů. Následně byly úspěšně použity i u podezřelých izolátů s mírnými příznaky (tzv. "mild" izoláty), v nichž nebyly detekovány nepoviry žádnou jinou běžně používanou primerovou kombinací.
Czech name
OPTIMALIZACE MOLEKULÁRNÍCH METOD K SIMULTÁNNÍ DETEKCI NEPOVIRŮ RONCETU RÉVY VINNÉ (GFLV) A MOZAIKY HUSENÍKU (ArMV)
Czech description
Předmětem práce bylo optimalizovat molekulární metodu reverzně transkripční polymerázovou řetězovou reakci (RT-PCR) tak, aby umožnila detekci nepovirů roncetu révy vinné (GFLV) nebo mozaiky huseníku (ArMV) v rámci jednoho experimentu. Tyto dva nepoviry jsou si z hlediska genomu a chování v rostlinných buňkách velmi podobné, proto bylo možné nalézt v rámci genomové RNA2 obou virů vysoce konzervativní sekvence v oblasti kódující pohybový protein (2BMP). Degenerované primery z této oblasti byly nejprve testovány na izolátech s ověřenou infekcí jedním z virů. Následně byly úspěšně použity i u podezřelých izolátů s mírnými příznaky (tzv. "mild" izoláty), v nichž nebyly detekovány nepoviry žádnou jinou běžně používanou primerovou kombinací.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QH91214" target="_blank" >QH91214: New biotechnolgical approaches for nepovirus resitance creation in grapevine rootstock cultivars.</a><br>
Continuities
V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju
Others
Publication year
2010
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda, vědecká příloha
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
12
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
4
Pages from-to
—
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—