Factors influencing resistance of UV-irradiated DNA to the restriction endonuclease cleavage

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F04%3A00104655" target="_blank" >RIV/68081707:_____/04:00104655 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Factors influencing resistance of UV-irradiated DNA to the restriction endonuclease cleavage

Original language description

DNA molecules of pUC19, pBR322 and PhiX174 were irradiated by various doses of UV light and the irradiated molecules were cleaved by about two dozen type II restrictases. The irradiation generally blocked the cleavage in a dose-dependent way. In accordance with previous studies, the (A + T)-richness and the (PyPy) dimer content of the restriction site belongs among the factors that on average, cause an increase in the resistance of UV damaged DNA to the restrictase cleavage. However, we observed strongeffects of UV irradiation even with (G + C)-rich and (PyPy)-poor sites. In addition, sequences flanking the restriction site influenced the protection in some cases (e.g. HindIII), but not in others (e.g. SalI), whereas neoschizomer couples SmaI and AvaI, or SacI and Ecl136II, cleaved the UV-irradiated DNA similarly. Hence the intrastrand thymine dimers located in the recognition site are not the only photoproduct blocking the restrictases.

Czech name

Faktory ovlivňující odolnost DNA ozářené ultrafialovým světlem vůči štěpení restrikčními endonukleasami

Czech description

DNA molekul pUC19, pBR322 a PhiX174 byla ozářena různými dávkami ultrafialového (UV) světla a následně byla štěpena více než dvaceti restriktasami typu II. Štěpení bylo obecně inhibováno ozářením, v závislosti na velikosti dávky. V souladu s dřívějšími studiemi, mezi faktory, které jako celek způsobují zvýšení odolnosti DNA (poškozené UV světlem) vůči restriktasovému štěpení, patří bohaté zastoupení (A+T) párů a obsah dimérů (PyPy). Nicméně jsme pozorovali silný vliv ozáření UV světlem i na úseky bohaté(G+C) páry a chudé na diméry (PyPy). Navíc, sekvence obklopující restrikční místo v některých případech ochranu před štěpením ovlivňovaly (např. HindIII), zatímco v jiných nikoliv (např. SalI). Přitom neoschizomerové páry SmaI a AvaI, nebo SacI a Ecl136II štěpily DNA ozářenou UV světlem podobně. Tudíž vnitrořetězcové thyminové diméry uvnitř rekogničního místa nejsou jediným fotoproduktem, blokujícím restriktasové štěpení.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

International Journal of Biological Macromolecules

ISSN

0141-8130

e-ISSN

—

Volume of the periodical

34

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

10

Pages from-to

213-222

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—