Guanine quadruplex formation by RNA/DNA hybrid analogs of Oxytricha telomere G4T4G4 fragment

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F08%3A00311863" target="_blank" >RIV/68081707:_____/08:00311863 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Guanine quadruplex formation by RNA/DNA hybrid analogs of Oxytricha telomere G4T4G4 fragment

Original language description

Using circular dichroism spectroscopy, gel electrophoresis, and ultraviolet absorption spectroscopy, we have studied quadruplex folding of RNA/DNA analogs of the Oxytricha telomere fragment, G4T4G4, which forms the well-known basket-type, antiparallel quadruplex. We have substituted riboguanines (g) for deoxyriboguanines (G) in the positions G1, G9, G4, and G12; these positions form the terminal tetrads of the G4T4G4 quadruplex and adopt syn, syn, anti, and anti glycosidic geometries, respectively. We show that substitution of a single sugar was able to change the quadruplex topology.

Czech name

Tvorba guaninových tetraplexů u RNA/DNA analogů Oxytricha telomerního fragmentu G4T4G4

Czech description

Pomocí CD spektroskopie, gelové elektroforézy a UV absorpční spektroskopie jsme studovali uspořádání tetraplexu u RNA/DNA analogů Oxytricha telomerního fragmentu G4T4G4, který tvoří velmi dobře známý basketový antiparalelní tetraplex. Provedli jsme substituce riboguaninů (g) za deoxyriboguaniny (G) v pozicích G1, G9, T4 a G12; tyto pozice tvoří terminální tetrády tetraplexu G4T4G4 a zaujímají syn, syn, anti, a anti geometrii. Ukazujeme, že substituce jednoho cukru může vést ke změně tetraplexové topologie.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Biopolymers

ISSN

0006-3525

e-ISSN

—

Volume of the periodical

89

Issue of the periodical within the volume

10

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

10

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000258844600001

EID of the result in the Scopus database

—