Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F06%3A00042520" target="_blank" >RIV/68081766:_____/06:00042520 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae)

Original language description

We described the structure and diversity of exon 2 of the MHC class II DQA gene in three species of voles (Arvicolinae) exhibiting regular multi-annual fluctuations of population density and analysed the processes leading to the observed MHC polymorphism. All exon 2 sequences translate to give unique amino acid sequences and positive selection was found to act very intensively on antigen binding sites. We documented the presence of recombination at vole DQA region but its importance in generating allelic polymorphism seems to be relatively limited. For the first time with rodents, we documented the duplication of the DQA gene in all three species with both copies being transcriptionally active.

Czech name

Duplikace, balancující selekce a trans-species evoluce vysvětlují vysoký stupeň polymorfismu genu DQA (MHC Class II) u hrabošů (Arvicolinae)

Czech description

Použitím klonování, sekvenování a SSCP byl popsán polymorfismus DQA genu (MHC Class II) u tří druhů hrabošovitých hlodavců. Všechny sekvence exonu 2 jsou jedinečně přepisovatelné a vykazují známky balancující selekce (trans-species evoluce, vysoký početmutací v pozicích kódujících ABS). Poprvé u hlodavců je zjištěna duplikace DQA genu u všech tří sledovaných druhů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Immunogenetics

ISSN

0093-7711

e-ISSN

—

Volume of the periodical

58

Issue of the periodical within the volume

2-3

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

12

Pages from-to

191-202

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—