Long-term reinfection of the human genome by endogenous retroviruses
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F04%3A00105341" target="_blank" >RIV/68378050:_____/04:00105341 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Long-term reinfection of the human genome by endogenous retroviruses
Original language description
Endogenous retrovirus (ERV) families are derived from their exogenous counterparts by means of a process of germ-line infection and proliferation within the host genome. Several families in the human and mouse genomes now consist of many hundreds of elements and, although several candidates have been proposed, the mechanism behind this proliferation has remained uncertain. To investigate this mechanism, we reconstructed the ratio of nonsynonymous to synonymous changes and the acquisition of stop codonsduring the evolution of the human ERV family HERV-K(HML2). We show that all genes, including the env gene, which is necessary only for movement between cells, have been under continuous purifying selection. This finding strongly suggests that the proliferation of this family has been almost entirely due to germ-line reinfection, rather than retrotransposition in cis or complementation in trans, and that an infectious pool of endogenous retroviruses has persisted within the primate lin...
Czech name
Dlouhodobá reinfekce lidského genomu endogenními retroviry
Czech description
Rodiny endogenních retrovirů (ERV) vznikly odvozením od svých exogenních protějšků procesem infekce zárodečných buněk a proliferace v hostitelském genomu. Řada rodin lidských a myších genomů dnes obsahuje mnoho set elementů a i když byly navrženy různé varianty, mechanismus jejich proliferace je nejasný. K vyšetření tohoto mechanismu jsme rekonstruovali poměr nesynonymních a synonymních změn a nabytí stop kodonů během evoluce rodiny lidských ERV HERV-K(HML2). Ukazujeme, že všechny geny včetně env, kterýje nezbytný pouze pro přenos mezi buňkami, byly po stálou očistnou selekcí. Tento poznatek výrazně naznačuje, že proliferace této rodiny byla téměř zcela zajištěna reinfekcí zárodečných buněk a ne retrotranspozicí v cis či komplementací v trans a že infekční zásoba endogenních retrovirů přetrvala v linii primátů v průběhu posledních 30 milionů let. Jelikož mnoho elementů v této zásobě by muselo být nefixovaných, je možné, že rodina HERV-K(HML2) v současnosti stále ještě obsahuje infe...
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LN00A079" target="_blank" >LN00A079: Center of Integrated Genomics</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2004
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
ISSN
—
e-ISSN
—
Volume of the periodical
101
Issue of the periodical within the volume
14
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
6
Pages from-to
4894-4899
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—