Elastic Registration of Successive Stacks of Optical Sections Captured by a Confocal Laser Scanning Microscope - a Module for the Rapid3D User Software Interface
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21460%2F07%3A12132753" target="_blank" >RIV/68407700:21460/07:12132753 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Elastická registrace následných souborů optických řezů získaných rastrovacím laserovým konfokálním mikroskopem - modul uživatelského softwarové rozhraní Rapid3D
Original language description
Elastická registrace je zde aplikována pro objemovou rekonstrukci biologických preparátů s vysokým rozlišením. Preparáty jsou snímány rastrovacím laserovým konfokálním mikroskopem a jejich tloušťku je nutné přizpůsobit hloubce proniku laserového paprskukonfokálního mikroskopu. Toto přizpůsobení se děje mikrotomem, kdy z biologického preparátu jsou nakrájeny tenké fyzické řezy o požadované tloušťce. Modul pro elastickou registraci následných souborů optických řezů umožňuje vertikálně slícovat série optických řezů, které byly získané z následných tenkých fyzických řezů téhož biologického preparátu konfokálním mikroskopem. Postupným lícováním všech sérií se vytváří digitální objem reprezentující celý biologický preparát. Fyzické krájení preparátu mikrotomem vnáší prostorové deformace a ztrátu části informace způsobenou prořezem. Elastická registrace umožňuje tyto efekty částečně kompenzovat a dosáhnout objemové rekonstrukce s menším množstvím prostorových diskontinuit.
Czech name
Elastická registrace následných souborů optických řezů získaných rastrovacím laserovým konfokálním mikroskopem - modul uživatelského softwarové rozhraní Rapid3D
Czech description
Elastická registrace je zde aplikována pro objemovou rekonstrukci biologických preparátů s vysokým rozlišením. Preparáty jsou snímány rastrovacím laserovým konfokálním mikroskopem a jejich tloušťku je nutné přizpůsobit hloubce proniku laserového paprskukonfokálního mikroskopu. Toto přizpůsobení se děje mikrotomem, kdy z biologického preparátu jsou nakrájeny tenké fyzické řezy o požadované tloušťce. Modul pro elastickou registraci následných souborů optických řezů umožňuje vertikálně slícovat série optických řezů, které byly získané z následných tenkých fyzických řezů téhož biologického preparátu konfokálním mikroskopem. Postupným lícováním všech sérií se vytváří digitální objem reprezentující celý biologický preparát. Fyzické krájení preparátu mikrotomem vnáší prostorové deformace a ztrátu části informace způsobenou prořezem. Elastická registrace umožňuje tyto efekty částečně kompenzovat a dosáhnout objemové rekonstrukce s menším množstvím prostorových diskontinuit.
Classification
Type
X - Unclassified
CEP classification
JC - Computer hardware and software
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů