Biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie a identifikace proteinových markerů infekce

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Šestý rámcový program Evropského společenství pro výzkum, technický rozvoj a demonstrační činnosti

Veřejná soutěž

FP6-2002-Mobility-12

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

RP - Spolufinancování programu EK

Číslo smlouvy

MSMT-2956/2012-36

Název projektu anglicky

Biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry and identification of protein markers of infection

Anotace anglicky

Fungi cause diseases of important crops. Their diagnostics is based on host specificity, symptoms and microscopy. Our joined team recently investigated an alternative based on intact cell mass spectrometry. This requires only a small amount of the material and takes the advantage of easy sample processing and fast data interpretation. Using two model pathogens, we have developed a methodology for both sample preparation and measurement on the instrument. For around ten microorganisms, we have obtained alibrary of protein mass spectra, which is available for taxonomic identification of field isolates. In the frame of a continuation project, we would like to finalize the methodology for biotyping of plant pathogens by direct measurements from infected material (leaf, stem) that would allow fast, cheap and reliable diagnostics. The studied microorganisms will be extended to pathogens of hop and grapevine. We also plan to discover infection biomarkers using detailed analysis of fungal surface proteins.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt je realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována sp?

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 2. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-MSM-7A-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2014

Celkové uznané náklady

140 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

140 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč