Identifikace a biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

7535/2010-32

Název projektu anglicky

Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry

Anotace anglicky

Downy and powdery mildews are obligate biotrophic plants pathogens causing severe diseases in economically important crops. Their diagnostics is currently based on a combination of host specificity, symptoms and microscopy. Although the relevance of phenotypic characters has been discussed, microscopic investigation still remains indispensable. However, this method depends strongly on systematic practice and experience of a plant pathologist. We suggest to develop an alternative approach based on mass spectrometry, which requires only very small amount of biological material and sample processing and data interpretation are fast and relatively easy. Database searches with comparing typical and unknown mass spectra then allow identification and taxonomical classification of microorganisms for example by principle component analysis. A majority of planned experiments will rely on mass spectrometric analyses of surface proteins released by an acidic treatment of the plant pathogens. In the frame of this

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

CB - Analytická chemie, separace

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl zkoumán alternativní přístup diagnostiky fytopatogenů s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie intaktních spor. Experimenty zahrnovaly optimalizaci metody přípravy vzorku a přímá měření z infikovaných listů hostitele.

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 4. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-MSM-ME-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 7. 2012

Celkové uznané náklady

160 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

160 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč