Vývoj metody pro kvantifikaci houbových patogenů na bázi RealTime PCR

Poskytovatel

Ministerstvo zemědělství

Program

Program I

Veřejná soutěž

Program I (SMZE2001_1_1)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.<br>Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Developent of a technique for the quantification of fungal pathogens based on Real-Time PCR approach.

Anotace anglicky

Real Time PCR is a technique of choice, which allows quantitative measurement of target template molecule - DNA/mRNA. Quantitative determination of the presence of a fungal pathogen in the leaf tissue is one of the possibility of application of the method. Such information is important for the investigation of plant-pathogen interaction and in some cases can be used to determine the quantity of pathogen present in derived food. Using Drechslera terez as a model object, optimisation of individual steps included in the development of standard method based on TaqMan probe approach will be carried out. TaqMan probes will be based on species-specific and form-specific sequences. The data will be obtained using sequencing of species and form-specific AFLP bands. Alternatively sequences of active genes will be analysed. Set of monosporiadial cultures of D. teres and related species will be used to gain the data. Along with that, information on occurrence and variability of different forms of pathogen wi

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Průběh řešení a výsledky odpovídají smlouvě. Cíl byl naplněn, požadované výstupy byly zpracovány. Zpracovaná metodika molekulární diagnostiky houbových patogenů zvyšuje přesnost diagnostiky proti stávajícím metodám.

Zahájení řešení

1. 1. 2001

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-MZE-QC-U/04:1

Datum dodání záznamu

29. 6. 2006

Celkové uznané náklady

3 000 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 000 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč