Genetické a fenotypické důsledky výškové diferenciace divokých populací modelového rodu Arabidopsis

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

č.j. MSMT-794/2018-13

Název projektu anglicky

Genetic and phenotypic consequences of altitudinal differentiation in wild populations of Arabidopsis

Anotace anglicky

Research (min. 2 articles in SCI journals) The principal objective of the proposed research is to elucidate the interplay between various levels of genetic and non-heritable mechanisms and the environment in the evolution of a distinct plant ecotype. Using transplant experiments and high-throughput DNA-sequencing screening across the genome we plan to address the following objectives: Objective 1) Does the relative contribution of the genotype vs. plasticity to the observed alpine phenotype vary across different mountain regions, reflecting different demographic history or local conditions? Do alpine populations exhibit local adaptation? • We will distinguish effects of heritable from non-heritable interactions between phenotype and alpine environment (i.e. phenotypic plasticity) in a reciprocal transplant experiment involving plants from different independently originated ecotypes. Objective 2) What are the demographic consequences of colonisation of a novel (i.e. alpine) environment? Did bottlenecks occur in some instances? • We will use genome-wide selectively neutral SNPs from genome resequencing to reconstruct past demographic processes linked to the shift from lowlands to the alpine zone. Objective 3) Does selection target the same genomic regions among independent alpine colonization events within the species? Are the candidate regions for selection associated with differences in local environment and/or phenotypic traits? • Using genome-wide genotyping of a comprehensive set of 16 populations we will contrast alpine populations of A. arenosa and their closest lowland counterparts and address the role of selection in shaping their genomic landscape of adaptation. Educational - dedicated meetings and talks at partner universities: sharing practical experience and result presentation (P. Schönswetter. E. Zaveska in Prague, G. Wos, F. Kolář in Innsbruck) - popular-science article on the influence of habitat and polyploidy on plant traits (Živa)

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována správnost čerpání přidělených financí a přiměřenost jejich využití.

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 2. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-MSM-8J-U/01:1

Datum dodání záznamu

24. 6. 2020

Celkové uznané náklady

173 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

173 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč