Studium propagace rostlinných virů v reprodukčních orgánech rostlin pomocí „light sheet“ mikroskopie

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

MSMT-5501/2021-13

Název projektu anglicky

Study of plant virus propagation during sexual reproduction by light sheet microscopy

Anotace anglicky

1) Selection of suitable reporter lines of A. thaliana and labelled virus strains for microscopy Both laboratories possess readily available lines that mark several specific tissues and cell lineages of A. thaliana in different developmental stages of the shoot apical meristem and the germline. Several combinations of reporter lines and labelled viruses will be tested in Brno in order to specify the best pairs to study antiviral meristem barrier. The empirical observation is necessary, because labeled proteins often give different optical outcomes in the light sheet according to our experience. Infected plants as well as non-infected controls need to be evaluated in different developmental stages and different stages of infection. Marco Incarbone will be in charge of virus cultivation, plant infection as well as monitoring the viral progression. The Riha lab will be responsible for correct sample preparation and microscopy setup to ensure best possible outcome. 2) Optimisation of sample preparation and cultivation conditions for microscopy. Recording static images is challenging, but ensuring the sample viability and physiological relevance is crucial. Infected flowers often come in irregular or distorted shapes. Preparing such samples need thorough examination and testing to achieve reproducibility. Correct position in microscope in respect with future growth is of an essence. Adjusting growth media might also be necessary. Neverthless, several years of experience with sample preparation gives us a good baseline to progress quickly in this direction. 3) Development of image processing workflow to process big data volumes. Growth of virus infected flowers and meristems may pose a challenge to properly display and analyze time lapse images that will be under supervision of Dr. Valuchova.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10601 - Cell biology

OECD FORD - vedlejší obor

10607 - Virology

OECD FORD - další vedlejší obor

10611 - Plant sciences, botany

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie<br>EE - Mikrobiologie, virologie<br>EF - Botanika

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována správnost čerpání přidělených financí a přiměřenost jejich využití.

Zahájení řešení

1. 1. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

3. 5. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-MSM-8J-U

Datum dodání záznamu

30. 6. 2023

Celkové uznané náklady

126 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

126 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč