Vizualizace a zpracování 3D obrazových dat z konfokálního mikroskopu s využitím programování grafické procesorové jednotky a virtuální reality

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 11 (SGA02008GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

102/08/0691

Název projektu anglicky

Visualization and processing of 3D images captured by a confocal microscope using graphics processor unit programming and virtual reality

Anotace anglicky

The aim of the project is to develop a methodology for volume reconstruction, segmentation and stereological measurements of images captured by a confocal laser-scanning microscope from large biological tissue specimens using three-dimensional (3D) imaging, virtual reality and graphics processor unit (GPU) programming. We will develop a software system performing volume reconstruction taking into account specific features of captured data sets, which includes improvement of visual quality of images, merging images of horizontal fields of view and vertical merging of images of subsequent physical slices into a digital volume representation of the whole specimen. We will implement an elastic registration method for merging images of the subsequent physical slices. We will develop new algorithms for 3D segmentation taking advantages of visualization using real-time volume rendering and virtual reality. The algorithms will utilize image tensors with adequate modification of 3D-live-wire

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

JC - Počítačový hardware a software

CEP - vedlejší obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>20206 - Computer hardware and architecture

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Během projektu byla vyvinuta a publikována originální metodika pro objemovou rekonstrukci velkých biologických vzorků z konfokálních dat korigující nežádoucí deformace obrazů. Tato metodika byla rozšířena o využití moderní mikroskopické metody OPT (Opti?

Zahájení řešení

1. 1. 2008

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-GA0-GA-U/03:3

Datum dodání záznamu

9. 2. 2015

Celkové uznané náklady

1 826 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 826 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč