Rozpoznávání, vizualizace a měření vláknitých struktur v 3D prostoru
Cíle projektu
Vývoj metod pro segmentaci vláknitých struktur z trojrozměrných (3D) obrazových dat. Zejména vývoj algoritmů využívající model aktivní kontury a teorii grafů (tzv. "live wire" a "graph cut"), které se budou implementovat ve spojení s objemovými rekontrukcemi a s virtuální realitou. Metody budou aplikovány při segmentaci kapilár snímaných konfokálním mikroskopem. Po úspěšné segmentaci kapilár se vytvoří jejich trojrozměrná počítačová rekonstrukce a budou se měřit biologicky významné geometrické charakteristiky, jako je délka či délková hustota kapilár.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
M2 - Mezinárodní spolupráce
Číslo smlouvy
1484/2009-32
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Segmentation, visualization and measurement of fibrous structures in 3D
Anotace anglicky
Development of methods for segmentation of fibrous structures from 3- dimensional (3D) image data, especially the development of algorithms using active contour model and graph theory (so called "live wire" and "graph cut"), implemented in combination with volume rendering and virtual reality. Methods will be applied for segmentation of capillaries captured by a confocal microscope. After the successful segmentation of capillaries, their 3D reconstruction will be made and biologically important geometrical characteristics, such as capillary length or length density will be measured.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
JC - Počítačový hardware a software
CEP - vedlejší obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
20206 - Computer hardware and architecture
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Vyvinuli jsme algoritmy pro segmentaci vláknitých struktur, ověřili je na reálných mikroskopických datech a využili při tvorbě trojrozměrných rekonstrukcí i při měření geometrických charakteristik vláken, zejména délky kapilár.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2008
Ukončení řešení
31. 12. 2009
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
9. 3. 2009
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP10-MSM-ME-U/01:1
Datum dodání záznamu
30. 6. 2010
Finance
Celkové uznané náklady
83 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
83 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
83 tis. Kč
Statní podpora
83 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEP
JC - Počítačový hardware a software
Doba řešení
01. 01. 2008 - 31. 12. 2009