Evoluční a ekologické faktory v evoluci genomu bakteriálních symbiontů hmyzu.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-01878S

Název projektu anglicky

Evolutionary and ecological factors in genome evolution of bacterial symbionts in insects.

Anotace anglicky

The project studies genome evolution of insect-associated bacteria during the process of symbiogenesis. It compares several lineages of insect symbionts of the genera Arsenophonus and Sodalis with different ecological roles in their hosts (parasites, facultative symbionts, obligate mutualists). It also takes advantage of our previous research which revealed several systems of different complexity, some represented by single symbiont and others by more complex symbiotic community. The main traits to be compared are the degree of genome reduction and degeneration, loss of particular genes, structure of metabolic pathways and occurrence of horizontally transferred genes. The data will be obtained by genomic and transcriptomic approaches and will be interpreted on the phylogenetic and ecological backgrounds. All selected symbiotic lineages are associated with bloodfeeding insects of the family Hippoboscidae, which allows for a comparison with closely related tsetse flies of the genus Glossina and their symbiotic community.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EG - Zoologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tento projekt doplnil některé do konceptu zákonitostí symbiózy a jejich evolucí mezi savým hmyzem a bakteriemi u skupin příbuzným mouchám tse-tse. Srovnáním symbióz jejich mikrobiomů s mouchami tse-tse ukazuje společné a alternativní evoluční trendy. Byly publikovány 4 publikace s celkovým IF 40,074, dva články v odborných časopisech a byla obhájena jedna bakalářská a jedna diplomová práce.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

7 980 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 980 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč