Vliv vnitrogenomové variability rDNA na koevoluční analýzu ve vztahu hmyz-symbiont
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
IAA601410708
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
An effect of rDNA intragenomic variability on coevolutionary analysis in insect-symbiont associations
Anotace anglicky
The project investigates 16S rDNA intragenomic heterogeneity in symbiotic bacteria and its influence on reconstruction of coevolutionary relationships. Our previous research showed that in Arsenophonus triatominarum, symbiont of triatomines, different copies of 16S rDNA provide conflicting phylogenies. This finding, together with high degree of compositional bias, suggests that A. triatominarum may have been associated with its host for considerably longer time than indicated by their incongruent phylogenies. We suggest that this phenomenon applies to other secondary symbionts and should be taken into account when inferring the coevolution. In the project, we map number and heterogeneity of 16S rDNA copies in lineages of Arsenophonus bacteria. To obtain more complex picture, we will screen for additional Arsenophonus lineages in insects. We use the degree of composition bias and the calculation of divergence times as subsidiary source of information on relative age of the associations.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EG - Zoologie
CEP - vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byla provedena podrobná fylogenetická a evoluční analýza symbiotických bakterií rodu Arsenophonus. Tato analýza prokázala evoluční plasticitu skupiny a výrazný vliv molekulárních artefaktů (např. vnitrogenomové variability) na koevoluční interpretaci.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2007
Ukončení řešení
31. 12. 2009
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
28. 4. 2009
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP10-AV0-IA-U/01:1
Datum dodání záznamu
8. 6. 2010
Finance
Celkové uznané náklady
2 129 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 129 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč