Role mesopolyploidie v evoluci čeledi Brassicaceae

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-10159S

Název projektu anglicky

Mesopolyploid events in the evolution of Brassicaceae

Anotace anglicky

Whole-genome duplication (WGD) events (polyploidy) are widespread in the plant kingdom and have the crucial role in generating genetic diversity. In contrast to paleopolyploidy, evolutionary younger mesopolyploid events are detectable by methods of comparative cytogenetics and genomics. Preliminary cytogenetic analysis of bona fide diploid species suggested that several mesopolyploid events occurred among crucifers. Here we aim to identify and characterize several WGD events across Brassicaceae by comparative chromosome painting and transcriptome sequencing. We will reconstruct ancestral subgenomes of the mesopolyploid taxa and follow the process of genome diploidization. We will investigate what karyotypic changes the duplicated genomes have undergone, and what mechanims mediated chromosome number reduction in these quasi-diploids. Whole-transcriptome sequence analysis will be employed to corroborate cytogenetic data and phylogenetically place the WGD events. We will test whether mesopolyploid events had direct impact on adaptive radiation and species richness of mesopolyploid taxa.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení tohoto ambiciózního projektu výrazně přispělo k charakterizaci celogenomových duplikací v čeledi brukvovité, objasnění jejich úlohy v evoluci a adaptaci jednotlivých druhů na měnící se ekologické podmínky. Výsledky byly publikovány v prestižních časopisech kategorie „Plant Science“ (2 publikace v časopisu Plant Cell), další rukopis byl přijat k publikaci v časopisu Plant Journal.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

25. 4. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

10. 4. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

6 835 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 835 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč