Genomické substráty chromosomových přestaveb a dysploidie během evoluční diversifikace rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní grantové projekty hodnocené na principu LEAD Agency

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

21-07748L

Název projektu anglicky

Genomic substrates of chromosome rearrangements and dysploidy during plant evolutionary diversification

Anotace anglicky

Genome divergence is usually associated with restructuring events, such as gene loss, chromosome rearrangements (CRs) and activity of transposable elements (TEs). Some CRs result in the reduction of duplicated chromosome sets (descending dysploidy). Mechanisms, molecular features and evolutionary significance of these genome reorganizations, as well as the role of descending dysploidy in speciation and cladogenetic events, remain underexplored. Comparative studies among closely related species with differently progressed descending dysploidy are necessary to assess the causes and consequences of descending dysploidies. We aim to sequence, analyze and compare nine Biscutella genomes (Brassicaceae) with different genome sizes and chromosome numbers. Chromosome-scale sequence assemblies will allow for comparative analyses quantifying small- vs. large-scale restructuring events affecting coding vs. non-coding genome fractions. By analyzing the role of gain vs. loss of genes vs. TEs in genome organization, we will assess how dysploid CRs contributed to species divergence.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

4. 5. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GF-R

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

12 160 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 821 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

339 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč