Post-polyploidní evoluce genomů v tribu Microlepidieae (Brassicaceae)

Název projektu anglicky
Post-polyploid genome evolution in Microlepidieae (Brassicaceae)
Anotace anglicky
Recurring polyploidization and post-polyploid diploidization (PPD) cycles have shaped genome evolution, speciation and cladogenesis in plants. Yet, little is known about interactions and functional divergence of subgenomes during PPD. The crucifer tribe Microlepidieae (MICR) originated via an inter-tribal hybridization and exhibited clade-specific PPD and diversification. To gain greater insight into the subgenome evolution in MICR and evolution of its parental genomes, we propose to generate high-quality genome and transcriptome assemblies in four tetraploid species and four diploid species representing both parental lineages. Our aim is to (i) establish genomes structure of these species, (ii) specify intra- and inter-subgenome rearrangements, (iii) reveal patterns of gene fractionation and subgenome dominance, (iv) elucidate dynamics of transposable elements and small-scale genomic variations, and (v) employ phylogenomic approaches to date species divergences and polyploidization(s). Our findings will advance our understanding of post-polyploid genome evolution in plants.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EF - Botanika

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GJ-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023

Podobné projekty(10)