Neznámý Nový svět: genomy severoamerických druhů tribu Arabideae

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE II

Veřejná soutěž

SMSM2022LU001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-1942/2023-2

Název projektu anglicky

The unknown New World: genomes of North American Arabideae species

Anotace anglicky

The goal of this project is to investigate the genome structure and mode of origin of 20 to 30 species of the tribe Arabideae of the mustard family (Brassicaceae) endemic to North America. Tribe Arabideae is the most species-rich group of crucifers, comprising 15 genera and nearly 500 species. The species diversity of Arabideae in North America is also considerable - the four genera include about 140 species, most of which (~120) belong to the genus Draba. Polyploidization has been a major contributor to the exceptional species richness of Arabideae, especially in the genus Draba (Jordon-Thadenet al., 2013). Because the base chromosome number in Arabideae is x = 8, diploids have two sets of chromosomes (i.e., 2n = 16), whereas tetraploids exhibit 2n = 32, hexaploids exhibit 2n = 48, and so on. The vast majority of Eurasian Arabideae exhibit this classic „euploid“ series, with all observed chromosome numbers being multiples of x = 8. However, most North American taxa exhibit a fundamentally different pattern of chromosomal evolution. Here, Arabideae with euploid numbers are rare; most species exhibit dysploid chromosome numbers bridging the gap between 2n = 16 and 2n = 32. A nearly continuous series of base numbers between diploid and tetraploid (i.e., 2n = 18, 20, 22, 24, 26, and 30), and an extensive array between tetraploid and octoploid (2n = 36, 40, 44, 52, 54, and 56) have been documented (Windham, 2000, 2003). We hypothesize that the different base chromosome numbers resulted from interspecific hybridization (allopolyploidization), subsequent genome-wide diploidization including descending dysploidy, and in some cases another round of allopolyploidization. However, no prior analysis was performed to examine these assumed evolutionary processes. Within all crucifers (~4,000 species), Eurasian Arabideae species are characterized by remarkable dynamics of chromosome evolution due to centromere mobility (Mandáková et al., 2020).

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 3. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 2. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MSM-LU-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

7 501 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 501 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč